学校拥有一批较高水平的教学科研平台,现有9个省、部级实验室。国家中医药管理局科研三级实验室2个:中药药理实验室、中药药理(免疫)实验室;云南省高校重点实验室3个:云南省高校民族药现代研究重点实验室、云南省高校中医药分子生物学重点实验室、云南省高校天然药物活性成分与功能重点实验室;云南省高校工程研究中心1个:云南省高校中药材优良种苗繁育工程研究中心;云南省高等学校本科实验教学示范中心3个:基础医学实验教学示范中心、临床技能综合模拟实验中心、中药学实验教学示范中心。设有 “云南省民族医药保护与产业发展研究基地”、“云南省高校中医药临床科研重点实验室培育基地”,国家药品食品监督管理局批准的中药新药GCP中心1个。学院有教学实验室18个,科研实验室 15个,其中有科级建制的实验室10个。